微波是100MHz~100000MHz波段的电磁波，以微波的温度场与电磁场相比较，电磁场是细菌致死的主要原因。特别是在较低温度时，非热因素杀菌效果，突破了传统杀菌工艺，而食品的品质不变，延长保质期，环保节能。
微波食品杀菌优点：
（1）快捷：常规杀菌，是通过热传导、对流或辐射等方式，将热量从食品表面传至内部。往往需较长时间，内部才能达到杀菌温度。微波则利用其透射作用，以热效应和非热效应的共同作用，使物品内外均匀迅速升温，只要几秒或者数十秒即达到相同的效果。而且设备可24小时连续工作，大大提高了企业的赢利效率；
（2）持久保鲜：由于微波在低温和短时间，就能均匀杀灭虫害细菌，所以并不影响食品的色香味，起到持久保鲜的作用；
（3）操作简单：微波设备操作简便，没有热惯性，能根据生产工艺，实时调控。整条生产线只需1名操作工，温度在75～80℃，处理时间3～5分钟；
（4）节能环保：微波电磁转换率高，一般在70%以上，优于传统加热的电热效率。同时，微波是直接对食品进行磁热能转换，微波加热器本身不会被加热，因而不存在额外的热功耗，相比节电50%左右；
（5）工艺：微波杀菌不需要锅炉，复杂的管道系统以及煤场和运输车辆等，只需水电基本条件即可。而且，微波杀菌设备无高温余热，不产生热辐射，能改善工作环境，设备结构紧凑、节省厂房面积；
（6）应用案例：微波杀菌开始于1976年，据日本统计，用于糕点、米面等食品杀菌的微波功率容量已占工业微波总量的34%。与此同时，欧美发达国家，早已把微波杀菌技术用于切片面包的包装线上。瑞典一家公司安装一台2450MHz的微波面包杀菌机，处理4400磅/小时的面包片，温度由20℃上升到80℃，时间仅需1～2分钟，处理后的面包片保存期由原来的3～4天延长到30～40天。荷兰的每日食品公司，对盒装鱼肉等食品进行微波保鲜处理，产品均匀加热到72～75℃后，可在0～4℃冷藏柜中保存6星期，保证原味不变，新鲜如初，价格与冷冻食品接近，处理量为1500公斤/小时。
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