（二）政府部门法规不完善
　　1、政府职能部门关系没有理顺
　　食品安全法律体系行政主体涉及到许多部门：国家食品药品监督管理局、卫生部、农业部、国家质量监督检验检疫总局、国家工商行政管理总局、商务部、粮食局、教育部、铁道部、交通局、建设部等等许多政府行政管理部门，政府职能部门不协调。
　　2、食品安全的信息发布较混乱
　　《食品卫生法》规定了卫生行政部门应当公布食品卫生情况，《产品质量法》也规定了产品质量监督部门应当定期发布其监督抽查产品的质量状况公告，但由于执法部门职能交叉，也由于执法部门职能交叉，也由于法定的食品安全信息发布部门的缺失，在2004年初安徽阜阳假奶粉事件中，发生了多个执法部门纷纷向公众发布“不合格奶粉名单”和“放心奶粉名单”，如质检部门、卫生部门、工商行政管理部门等。甚至有些部门因为发布前没有很好沟通检验标准、协调将要发布的信息内容，导致个别奶粉同时出现在“不合格”或“放心”中。《国务院关于进一步加强食品安全工作的决定》中提到：质检、工商、卫生和食品药品监管4个部门联合发布市场食品质量监督检查信息，食品药品监管局负责收集汇总、及时传递、分析、整理，定期向社会发布食品安全综合信息。但这是一个规范性文件，至今没有一个法律法规具体对食品安全信息发布部门作出统一规定。
　　（三）标准体系不完善
　　食品安全标准体系存在的主要问题是标准体系不完善，标准之间相互冲突，标准的主体不规范，表现为以下6个方面：
　　一是标准滞后。标准滞后表现为标准多少年不变，且与WTO不相适应。如粮食（玉米）质量标准20多年不变，而粮食现在分为口粮、饲料粮、工业用粮，至今采取统一的标准，口粮质量要求应该较高，饲料粮质量标准相对较低，工业用粮需要标准专一的粮食，如果采取统一的粮食标准，必然会导致：（1）资源浪费，按统一的口粮标准，许多符合饲料粮、工业用粮的粮食应不符合质量标准；（2）标准不符合实际，因为同一品种由于有不同的专业需求，于是就要求有不同的质量标准；（3）不能够保证食品安全，不同类别的产品用途，要求有不同质量的产品标准，如果乱用必然导致食品不安全。
　　二是标准混乱。我国食品安全的标准体系由国家标准、行业标准、地方标准、企业标准构成，但许多标准没有认真地执行，是因为标准分散交叉，缺乏协调机制，目前许多标准分散于农业、质监、卫生等六七个部门，无公害食品、绿色食品、有机食品、QS食品等多种质量标准，使企业、消费者混淆不清。至今我国食品质量标准有3000多个，由于多头管理，交叉冲突，存在监管“真空”。
　　三是标准无法沟通。由于标准不规范、标准混乱，以致政府与企业、企业与企业、企业与消费者之间无法进行有效地沟通，甚至国内企业与国外政府、企业、消费者等无法进行有效地沟通，在目前我国没有掌握标准主动权的情况下，有效地沟通更具有重要意义，许多有效标准应积极向世界进行推介。
　　四是标准不完善。全国果冻制造企业近300家，产量约60万吨，总销售收入近50亿元，已经超过日本成为世界zui大的市场之一，但全国有两个果冻标准，如卫生部和国家标准委于2003年9月发布的《果冻卫生标准》，另一份是轻工行业标准，两个标准都对果冻的原料、色泽、滋味、性状、理化指标、微生物指标、食品添加剂等提出了要求，但都没有对果冻大小形状以及包装标志上的警示语等作出强制性规定。这也是近几年来不断发生儿童因吃果冻窒息死亡事件的原因之一。
　　五是标准体系不完善。目前我国有《食品添加剂使用标准》等食品质量标准近3000个，而与流通有关的标准仅有100余个，相比于生产和加工标准数量差距甚大，流通过程保障食品安全的标准严重不足，即使食品生产质量合格，也难保不在流通环节出现质量安全问题。可喜的是《食品中苏丹红染料的检测方法-液相色谱法》国家标准也及时出台，弥补了空白点。
　　六是食品质量检测标准不统一。主要表现在食品安全标准和检测方法上：
　　（1）食品标准不统一是困扰生产者、执法者和消费者的一大难题。2004年震惊全国的毒“黄花菜”事件，充分暴露了同一个产品在不同部门之间标准不同带来的麻烦。我国没有专门针对黄花菜含硫量的鉴定标准，只能参照卫生部关于干菜类食品的卫生标准执行。按此标准，黄花菜含硫量不能超过0.035毫克/千克。沈阳市卫生监督所正是根据这一数据对24.5吨“毒黄花菜”进行了查处，从而引发了社会各界对“毒黄花菜”问题的广泛关注。但是，国家农业部颁布的《无公害脱水蔬菜标准》（NY5184-2002）规定二氧化硫量数值的规定差之千里，造成黄花菜农无所适从，黄花菜生产厂商叫苦不迭，某些执法部门盲目执法，政府的监管效率也大打折扣。这一问题引起国务院的高度重视，2004年8月9日，卫生部发布了2004年第16号公告，扩大了焦亚硫酸纳的硫磺的使用范围和使用量，提出黄花菜中二氧化硫残留标准不得超过200毫克/千克，至此，黄花菜的含硫量标准终于统一。（2）检测方法的差异也可能导致截然不同的检测结果。比如地磅和天平，由于感量不同，一个到公斤，一个到毫克，检测结果肯定不一样。（3）按国家标准，每公斤面粉中面粉增白剂含量不得超过0.06克，但有的专家认为面粉中根本不能添加面粉增白剂。
　　七是我国食品流通检测及环保体系仍不健全。建立检测中心、配有垃圾处理设备的食品零售企业和农贸市场所占比例偏低；消费者对任何一类食品安全性的信任度均低于50%。检测体系不健全，还表现为各自为阵，许多市场、企业自建质量检测中心，导致遍地开花，重复建设，趋同投资，而具有社会化服务功能的质量检测机构相对较少，且服务又不到位，导致各部门的检测资源不能共享，快速检测的技术手段落后。
　　五、完善食品安全法律体系的对策
　　（一）尽早出台《食品安全法》
　　1、新《食品安全法》的主要框架结构
　　（1）监管目的：综合促进和保障食品安全——使食品生产经营秩序得到明显好转，生产、销售假冒伪劣和有毒有害食品的违法犯罪活动得到有效遏制，大案要案得到及时查处，食品安全事故大幅度下降，城乡居民食品消费安全感增强，其日益增长的食品安全和健康需求不断得到满足，我国食品信誉得到恢复和提高。
　　（2）监管范围：国家对食品安全实行“从农田到餐桌”的全程监管，这是现代市场经济的新理念，将其置换原有的“食品卫生”的理念。
　　（3）监管体制：以法律的形式提出我国食品安全基本监管框架和各方职能。
　　（4）监管原则：确保人民身体健康，注重科学依据，控制和预防并重，公开、客观、公正等；
　　（5）社会其他阶层的责任：以食品生产经营企业为主，还包括与食品相关的行业、食品行业协会以及消费者等，“政府监管、行业自律、社会监督”为主要内容的监管体系；
　　此外还应包括应急处理、标准检测（含市场准入）、安全风险评价、信用体系、食品安全信息网、宣传教育、行业协会、研究机构推动、法律责任等内容。
　　2、新的《食品安全法》应体现符合现代社会市场经济要求的科学食品安全监管体系。如：
（二）尽快实现法律、法规、标准的无缝连接
　　尽快出台《食品安全法》，并以其为核心形成法律、法规、标准的无缝连接，即以食品安全法为核心，形成一个统一的、协调的、不冲突的、相互衔接的、不矛盾的法律、法规、规章、标准的群体体系。
　　1、《食品安全法》与其他法律、法规、规则、标准相配套
　　《食品安全法》与《关于进一步做好食品安全工作的决定》（国务院核心法规）、《生猪屠宰管理条例》（修订中）、《畜牧法》（草案）、《动物防疫法》、《出入境动植物检疫法》、《农产品质量安全法》（草案）等的衔接。与《食品安全标准》、《食品安全信息管理条例》、《食品认证认可管理条例》、《食品标识管理办法》、《农产品质量安全法》、《食品安全促进法》等，形成完善我国法律、法规、规章、规划和标准相配套的食品安全法制体系。
　　2、尽快完善食品安全标准体系
　　1961年第十六届世界卫生大会通过了创建食品法典委员会（CAC）的决议，现今食品法典已成为消费者、食品生产者和加工者、各国食品管理机构和食品贸易*的和zui重要的基本参照标准。自1986年以来，我国正式成为CAC成员国以来，CAC标准都是以科学为基础制定出来的，如能在当前食品安全标准体系中参照遵循这此标准，将国内食品标准尽快与CAC标准接轨，既可避免重复性工作，又可节省大量财力。
　　尽快建立健全中国食品安全标准体系应着重抓好5个方面的工作：（1）尽快完成食品国家标准、行业标准、地方标准、企业标准的清理；（2）强化企业产品标准备案措施，凡与国家法律法规、强制性标准要求不符的，一律取消备案；（3）对《全国食品标准2004—2005年发展计划》中提出的国家标准、行业标准制修订任务进行分解落实，重点安排食品卫生、食品生产安全、重要产品等400项标准的修订和200项标准的制定任务，力争制修订一批食品安全急需标准；（4）加快食品中有害物质*及其检测方法等重要标准的前期研究，进一步提高食品标准制修订工作的科学性和针对性；（5）加强《预包装食品标签通则》、重要食品卫生标准的宣传贯彻与培训，加强食品标准实施的监督检查，提高企业执行食品安全标准的自觉性。
　　3、加大对食品检验检测研究和应用的投入
　　在实行“从农田到餐桌”的管理的食品安全保障体系中，检测工作应当紧随标准的修订不断完善，2005年8月4日，由中国检验检疫科学研究院研究成功的《猪链球菌多重PCR检测方法》在北京通过了专家鉴定。该方法简便、快速、准确、特异性强，该方法将检测猪链球菌的时间从过去的4天减少到了4小时，达到了*水平。